Российский стратегический подводный крейсер специального назначения таинственно исчезает во время секретной операции в водах Гренландского моря. На его поиски отправляется команда под руководством Виктора Воронина, чей старший брат командовал пропавшей субмариной. Задача моряков — любой ценой найти подводную лодку и не допустить, чтобы новейшее секретное оружие не попало в руки противника.
В это же время из-за геологических исследований на полярной станции в северных водах пробуждается Кракен — мифическое чудовище, способное сливаться с темнотой и обладающее высоким интеллектом. Именно с ним предстоит столкнуться морякам, которые ищут пропавшую подводную лодку.